天然地下水流经锰砂过滤层时，水中低价铁锰离子先被覆盖于锰砂表面的活性滤膜所吸附，然后被氧化水解，生成氢氧化物水合分子形成新的活性滤膜，并作为新的催化剂参与接触氧化反应，使得活性滤膜不断增厚和自我修复，以达到除铁锰的作用。为加快活性滤膜的生成，缩短锰砂的稳定期，提高除铁锰的效果，一般在锰砂过滤器的进水处采取氧化法，氧化法通常有曝气或者加入氧化剂的方法。